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課程名稱 |
生物資訊學
Bioinformatics |
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開課學期 |
106-2 |
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授課對象 |
生命科學院 分子與細胞生物學研究所 |
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授課教師 |
阮雪芬 |
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課號 |
LS5075 |
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課程識別碼 |
B21 U2190 |
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班次 |
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學分 |
3.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期四7,8,9(14:20~17:20) |
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上課地點 |
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備註 |
課程要求：已修畢生物化學或分子生物學。上課地點：博雅408教室。
總人數上限：45人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1062LS5075_bi |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
本課程尚未建立核心能力關連 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
生物資訊學是結合分子生物學和電腦的科學，主要著重在利用電腦資料庫、演算法及統計學分析基因體和蛋白質體相關資料。課程除了教授基本的生物資訊學相關知識外，亦進行電腦實作分析，進而使學生了解並能應用於生物科學的研究上。 |
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課程目標 |
學生將能了解現今生物資訊學的知識，同時能將所學應用於生物學的研究。 |
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課程要求 |
已修過生物化學或分子生物學 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
1. Jonathan Pevsner, Bioinformatics and Functional Genomics (2nd edition,
Wiley-Blackwell, 2009) + (3rd edition, 2015)
2. Juan, H.-F. and Huang, H.-C. (2012) Systems Biology: Applications in cancer-related research (World Scientific Publishing, Singapore).
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參考書目 |
生物資訊相關的期刊論文: Bioinformatics (Oxford), Nature, Science, Molecular Systems Biology |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期末考 |
35% |
筆試 + 上機 |
2. |
作業 + 隨堂考 |
30% |
每周作業 + 隨堂考 |
3. |
期中考 |
35% |
筆試 + 上機 |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
3/1 |
Introduction |
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第2週 |
3/8 |
Access to sequence data and literature information
(許家郎博士) |
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第3週 |
3/15 |
Pairwise sequence alignment |
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第4週 |
3/22 |
Basic Local Alignment Search Tool (Blast) |
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第5週 |
3/29 |
Multiple sequence alignment |
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第6週 |
4/5 |
民族掃墓節(放假日) |
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第7週 |
4/12 |
Molecular phylogeny and evolution |
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第8週 |
4/19 |
Bioinformatic approaches to RNA |
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第9週 |
4/26 |
期中考 (筆試 + 上機) |
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第10週 |
5/3 |
Bioinformatics software practice I
(許家郎博士) |
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第11週 |
5/10 |
Gene expression data analysis |
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第12週 |
5/17 |
Bioinformatics software practice II
(許家郎博士) |
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第13週 |
5/24 |
Network biology |
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第14週 |
5/31 |
Proteomics |
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第15週 |
6/7 |
Protein Structure |
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第16週 |
6/14 |
Discovering Drug Targets for Cancer Therapy |
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第17週 |
6/21 |
Bioinformatics software practice III
(許家郎博士) |
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第18週 |
6/28 |
期末考 (筆試 + 上機) |
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